اوشیشوں کی ایک زنجیر کو ایک گرڈ میں موڑیں تاکہ ہائیڈروفوبک اکائیاں دفن شدہ کور میں گھس جائیں — اور توانائی کو اس کے ثابت شدہ کم سے کم تک نچوڑ لیں۔
ایک پروٹین کو 2D جالی پر ہائیڈروفوبک (H) اور قطبی (P) کی باقیات کی زنجیر کے طور پر بنایا گیا ہے۔ ہائیڈروفوبک پڑوسی جو بندھے بغیر ملحقہ بیٹھتے ہیں توانائی کو کم کرتے ہیں۔ آپ کا مقصد زنجیر کو فولڈ کرنا ہے تاکہ H باقیات ایک کمپیکٹ کور کی شکل اختیار کریں اور آپ زیادہ سے زیادہ توانائی حاصل کریں۔
ہیلکس فولڈ پروٹین فولڈنگ کے کلاسک ہائیڈروفوبک پولر جالی ماڈل پر بنایا گیا ہے، جو فولڈ کی تلاش کو ایک پہیلی میں بدل دیتا ہے۔
جالی پر آب گریز اور قطبی باقیات کی ایک زنجیر، جہاں غیر بندھے H-H رابطے توانائی کم کرتے ہیں، پروٹین کی تہہ بندی کا HP ماڈل ہے۔
کسی معلوم شکل سے مشابہت کے بجائے براہِ راست توانائی کو اسکور کرنا اس کھیل کا اپنا طریقہ ہے۔
توانائی ہی صحیح مقصد ہے کیونکہ فطرت اسی کو کم سے کم کرتی ہے۔ آب گریز اثر غیر قطبی باقیات کو اندر کی طرف دھکیلتا ہے، اور جس ماڈل میں اس کے سوا بہت کم ہو وہ بھی وہ ٹھوس مرکز دوبارہ پیدا کر لیتا ہے جو حقیقی پروٹینوں میں ہوتا ہے — اسی لیے HP ماڈل تدریس اور تحقیق کے آلے کے طور پر زندہ ہے۔
ہیلکس فولڈ کو پروٹین فولڈنگ کے کلاسک ہائیڈروفوبک پولر جالی ماڈل پر بنایا گیا ہے، جس سے کم از کم توانائی کی تشکیل کی تلاش کو ایک سپرش پہیلی میں تبدیل کر دیا گیا ہے۔ یہ ایک اصلی، مفت براؤزر گیم ہے جس میں تین سلسلہ کی لمبائی اور روزانہ پلس پریکٹس موڈز ہیں۔